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Servicios / Single Cell
10x Genomics CSP

Single Cell Sequencing

Resuelve la heterogeneidad celular que se pierde en bulk sequencing. Plataforma 10x Genomics Chromium operada por Certified Service Provider.

Cotizar single-cell Ver aplicaciones →
Descripción

Una célula, una secuencia, una historia.

Single Cell Sequencing permite analizar el transcriptoma, accesibilidad cromatínica o repertorio inmune de cada célula individual dentro de una muestra. Donde antes veíamos un promedio, ahora vemos cientos de tipos celulares con identidades únicas.

Operamos la plataforma 10x Genomics Chromium con todos sus assays: Single Cell Gene Expression, Single Cell Multiome (RNA + ATAC), Single Cell Immune Profiling y Single Cell ATAC.

Aplicaciones: oncología (TME), inmunología, neurociencias, biología del desarrollo, atlas celulares de tejidos.

Lo que recibes

FASTQ por libreríaCell Ranger compatible
Matriz cells × genes10x format · h5 + Loom
Pre-procesamientoCell Ranger / Cell Ranger ATAC
Análisis Seurat / ScanpyQC, normalización, clustering, UMAP
AnnotationSingleR · Azimuth · markers
Reporte HTMLInteractivo · explorable
Assays disponibles

Toda la familia 10x Chromium.

🧬

Gene Expression 3'

El estándar para perfilado transcriptómico. ~10.000 células / canal, 50.000 reads/célula.

🔓

ATAC-seq

Mapeo de accesibilidad cromatínica para inferir actividad regulatoria por célula.

⚙️

Multiome

RNA + ATAC en la misma célula — la información más completa por experimento.

🛡️

Immune Profiling 5'

TCR/BCR + transcriptoma para caracterización completa de células T y B.

🌐

Spatial · Visium

Transcriptoma con coordenadas espaciales en cortes histológicos.

🔬

Fixed RNA Profiling

Para muestras fijadas con formaldehído o FFPE recientes.

Servicio Single Cell

Solo secuenciación en NovaSeq X Plus.

No realizamos la preparación ni construcción de librerías single-cell. Nuestro servicio se limita exclusivamente a la secuenciación de librerías ya construidas por el cliente en plataforma Illumina NovaSeq X Plus.

Las especificaciones de la muestra y de la librería son altamente variables según el assay 10x usado (Chromium 3p v3.1, 5p v2, ATAC v1.1, Multiome, GEM-X 3p/5p v4, Visium fresh / FFPE, Fixed RNA, Kinnex single cell). Por eso, lo idóneo es ponerse en contacto directamente con un agente para evaluar las necesidades particulares de tu proyecto y la profundidad de secuenciación recomendada.

📧 Hablar con un especialista 🧬 Abrir NGS Explorador
Free tool · Google Colab

🧬 FASTQ.gz Viewer + Quality Control

Inspecciona tus archivos .fastq.gz antes o después del análisis: estructura de lecturas + histograma Phred (Q30) + contenido GC + calidad por posición estilo FastQC. Sin instalación, sin servidor, gratis.

📥 Descargar .ipynb Ver más info →
🛠

Cotiza tu proyecto single-cell.

Incluimos consultoría en preparación de muestra, profundidad y elección de assay.

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