Secuenciación completa de plásmidos (WPS).

Un ensamblaje más grande de lo esperado puede indicar multímeros plasmídicos, como dímeros o formas de orden superior, o deberse a otros factores de la muestra o del ensamblaje. Si el tamaño no coincide o ves repeticiones inesperadas, escríbenos con el tamaño previsto y, si la tienes, la secuencia de referencia, y revisamos el resultado.

Algunos contextos son más difíciles para las lecturas largas. Las regiones homopoliméricas (series de una misma base, como AAAAAA) y las repeticiones cortas en tándem pueden asociarse a errores de inserción o deleción, y algunas repeticiones terminales invertidas (ITR) pueden requerir una revisión cuidadosa. Si una región crítica da un resultado inesperado, puede recomendarse una revisión adicional o validarla con otro método, como Sanger.

WPS está diseñada para muestras con una única construcción plasmídica de origen clonal. Una mezcla de plásmidos, ADN plasmídico fragmentado o contaminación con ADN genómico puede reducir la calidad de los datos o dar un ensamblaje incompleto o inesperado.

Las causas más habituales son una concentración demasiado baja o demasiado alta, ADN degradado o contaminado, una mezcla de varios plásmidos o una cantidad de ADN insuficiente para alcanzar los datos previstos. Como no hay QC previo, conviene revisar la muestra antes de enviarla.

No en envíos internacionales. Por la normativa sobre organismos vivos modificados (LMO), actualmente solo se acepta ADN plasmídico purificado procedente del extranjero, y no ofrecemos purificación de plásmidos.